作为一座历史悠久的老城，济宁的文化底蕴是相当丰厚的。
在济宁，佛教文化、道教文化都相当繁盛，比如济宁市区的崇觉寺铁塔、大悲庵、凤凰台上的凤台寺都是历史悠久的佛教古迹，原址位于济宁市区的清华洞、枣店阁、王母阁等则是著名的道教场所。另外，因为唐代大诗人李白在济宁生活多年，所以济宁的李白文化也堪称是一大亮点。
不过和上面提到的佛教文化、道教文化、李白文化相比，济宁更重要的文化底蕴在于运河文化和儒家文化，只是儒家文化和运河文化在济宁谁主谁次一直难以定论。由于明清时期管理全国河运的最高权力机关河道总督衙门设在济宁，而且济宁凭借运河枢纽的交通地位一度成为全国知名的重要商业城市，所以济宁的运河文化在国内是首屈一指的。
至于济宁的儒家文化，主要是受到曲阜这一儒家文化发祥地的熏陶。历史上济宁城区范围内是任国的封地，而任国又是当时都城设在曲阜的鲁国的附属国，加上两地距离较近，文化交流与融合非常的充分，所以济宁是深受儒家文化熏陶与濡染的。从行*区划上讲，曲阜是济宁的下属县级市，曲阜的儒家文化资源实际上属于“大济宁”的一个组成部分。所以，济宁将儒家文化视为自身的文化底蕴是理所当然的。
将儒家文化与运河文化比较，无疑儒家文化的影响力更大，层级更高。一方面儒家文化是深入到人类思维深处的传统文化的重要内核，影响的范围是世界性的，影响的时间更为深远。而运河文化属于区域性阶段性的风俗文化，其文化地位和内涵价值远不如儒家文化。所以，从这个方面来说，笔者认为济宁文化底蕴中排在第一位的应该是儒家文化，运河文化虽然极富特色，也只能排在儒家文化之后。